Initialement, les travaux devaient se concentrer sur les deux tours les plus fragilisées.

Cependant, l'engagement financier de la Région, annoncé par son président Fabrice Pannekoucke, a été un levier décisif pour lancer un chantier complet.

Le coût total de l'opération est estimé à 5,2 millions d'euros. À ce jour, 4,7 millions sont assurés grâce à la contribution de la Région, à un appel aux dons publics ayant rapporté 2 millions d'euros, à un fonds de 200 000 euros de la Fondation du Patrimoine et au soutien de l'État via la DRAC. La Fondation Fourvière, propriétaire du monument, a lancé une nouvelle campagne de dons pour collecter les 500 000 euros manquants.

Le chantier doit débuter au premier trimestre 2026 et s'étaler sur 18 mois, pour une livraison prévue à l'été 2027.

La basilique restera ouverte aux trois millions de visiteurs annuels pendant toute la durée des travaux, bien que les visites insolites sur les toits puissent être affectées pour des raisons de sécurité.