Cependant, cette tendance inquiète l'exécutif parisien.

La multiplication des boutiques éphémères, en particulier dans des quartiers prisés comme le Marais, est perçue comme un facteur de déstabilisation pour le commerce traditionnel et durable. Pour contrer ce phénomène, la Ville a récemment activé son droit de préemption sur deux locaux commerciaux du Marais qui étaient destinés à accueillir des pop-up stores.

Cette action vise à préserver le tissu commercial local en favorisant l'installation d'enseignes pérennes.

L'ouverture d'une autre boutique éphémère dans le même quartier par L'Appartement Français, qui promeut le "fabriqué en France", montre la diversité du phénomène, mais la démarche de la Mairie cible avant tout la spéculation et la standardisation que peuvent engendrer les grandes marques internationales. La situation met en évidence une tension entre l'attractivité et le dynamisme générés par les pop-up stores et la nécessité de protéger l'identité et la stabilité des quartiers commerçants parisiens.