Cette restructuration vise, selon le groupe, à « rationaliser les opérations et d’améliorer l’efficacité en France ».

Le site de Saint-Herblain près de Nantes, qui accueillait des activités opérationnelles et de la recherche préclinique sur 3 178 m², cessera donc ses activités. Le siège social français de Valneva sera par ailleurs transféré à Lyon.

Cette décision n'est pas présentée comme une mesure d'économie dictée par des difficultés financières, mais plutôt comme un choix stratégique de consolidation. En effet, la réorganisation intervient dans un contexte de progression des indicateurs financiers de Valneva, qui a réalisé 127 millions d'euros de revenus sur les neuf premiers mois de 2025 et disposait d'une trésorerie de 143,5 millions d'euros à fin septembre. La nouvelle architecture organisationnelle clarifie la répartition des rôles au sein du groupe : Lyon devient le pôle administratif et opérationnel pour la France, tandis que Vienne se transforme en centre de gravité scientifique unique et mondial pour la R&D. Cette centralisation des équipes scientifiques vise à accélérer le développement des produits, notamment son candidat vaccin contre la maladie de Lyme, et à renforcer la compétitivité du groupe dans un secteur où la rapidité d'exécution est devenue un facteur clé.